Santo Amaro agora possui um campus da Universidade Federal de São Paulo (Unifesp). Construída em terreno de 15 mil m² doado pela Prefeitura, a unidade está localizada próxima ao Largo Treze, na rua Padre José Maria, 545, em frente ao Terminal Santo Amaro.

A universidade será destinada a cursos de extensão universitária. A nova estrutura possui quatro salas de aula, três salas para cursos de extensão latu sensu e salas de informática, onde serão ministrados cursos de inclusão digital e disciplinas semipresenciais.

O espaço conta, ainda, com dois consultórios destinados à complementação das aulas ligadas à educação física em parceria com a equipe de medicina esportiva. Programas sociais voltados à população local também serão instalados na unidade Santo Amaro como, por exemplo, a Universidade Aberta à Terceira Idade (UATI), o Cursinho Pré-vestibular Jeannine Aboulafia (CUJA) e o Projeto Social de Integração e Reintegração do Adolescente, Jovem e Adulto (Projeto Pirado).